使用ChemDraw输入3D分子结构到COSMOThermX中

热力学软件COMSOThermX18导入数据库中没有的组分 一文中,说了如何导入简单的,2D的分子结构的组分,然后今天我们来说如何使用ChemDraw来导入复杂分子和其3D结构。

首先打开ChemDraw,画出我们需要的组分,例如对二甲苯,然后框选整个分子,点击工具栏中的“Edit”,“Cope As”,“SMILES”:

什么是SMILES详见: 分子结构中的SMILES

然后粘贴到一个其他任何地方,其内容如下:

CC1CCC(C)CC1

然后打开COSMOThermX,点击“新组分”:

粘贴复制的SMILES到这里,点击搜索:

如果搜索之后发现数据库中有该组分,那就直接勾选,添加到组分列表即可。

点击生成3D结构:

然后就可以点击进行估算了:

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